II. Bayezit Dönemi, bayezitin kardeşi Cem, tahtın kendi hakkı olduğunu iddia ederek II. Bayezit’e karşı isyan etti.
Yenişehir Ovası’nda yapılan savaşı kaybeden Cem Sultan Memluklere sığındı. Daha sonra Saint Jean (Sen Jan) Şövalyelerinin davetiyle Rodos’a giden Cem Sultan şövalyeler tarafından Avrupa’ya götürüldü. 1495 yılına kadar papanın yanında ve Fransa’da tutulan Cem Sultan, 1495’te bir suikast sonucu öldürüldü.
Kemal ve Burak Reisler Venedik’in elinde bulunan Modon, Koron ve Navarin kalelerini ele geçirmiştir.
İspanya’da yaşayan müslüman ve yahudilere yardım gönderilmiştir.
Memlüklerle ilişkiler çatışmaya dönüşmüştür.
Şii tehdidi ortaya çıkmıştır.
Şahkulu Baba Tekeli İsyanı çıkmıştır. (Şii nitelikli)
Oğulları arasında taht kavgası yaşanmıştır.